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至多填写 65,536 条序列
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文件格式

文件格式为含有单张表单的 Excel 文件,您可以修改文件名,但请勿对表单名进行修改。

Oligo_ID_and_Seq 表单

表单含有四列信息
Oligo_No
每种寡核苷酸的索引编号

0 代表示例,1 至 4096/65536 代表用户需要合成的序列,请勿对该列进行任何修改、增删。

Oligo_ID
每种寡核苷酸的名称

相当于 FASTA 格式的“>”后的内容。

Oligo_Seq
每种寡核苷酸的序列

5′ -> 3′ 方向。

Redundancy
每种寡核苷酸的冗余度/拷贝数

默认为 1。

填写和校验规则

Oligo_ID_and_Seq 表单

Oligo_No
  • 需为连续、不重复的正整数。
  • 不应该被修改。
Oligo_ID
  • 如不想设置寡核苷酸的名称,可将所有行全部留空(序列将自动赋予 ID),但不允许部分填写、部分留空。
  • 不允许出现重复的 Oligo_ID,若该序列需要被合成多次,请设置 Redundancy,而非将该序列的信息复制多行。
  • 允许出现的字符包括大小写字母(A-Z、a-z)、阿拉伯数字(0-9)、
    部分字符(+-=_.:),禁止出现空格、全角字符(含中文)、 换行符、制表符和
    其他特殊字符。
  • 基于多数生物信息软件的限制,Oligo_ID第一个字符必须为大小写字母,不可以是数字或特殊字符。
Oligo_Seq
  • 允许出现的字符包括大小写字母(A-Z、a-z)、阿拉伯数字(0-9)。
  • 如无特殊要求,尽量使用大写 A、C、G、T 表示天然碱基,默认情况下,小写字母将被转换为大写。
  • 大写 R、Y、S、W、K、M、B、D、H、V、N 代表简并碱基,默认情况下,小写字母将被转换为大写。
  • 您可以使用N代表随机简并碱基,但如果需要合成非 N 的简并碱基类型(如 R、Y、S、W、K、M、B、D、H、V),请联系我们的客户经理进行说明和确认。
  • 非 A、C、G、T、R、Y、S、W、K、M、B、D、H、V、N 字符(含数字)可代表 特殊单体、特殊合成工艺或修饰基团,如需使用,请联系我们的客户经理进行说明和确认。
  • 如您的大小写字母代表不同的单体或合成工艺,请联系我们的客户经理进行说明和确认。
Redundancy
  • 需为正整数。
  • 如不填写,则 Redundancy 默认设置为 1。
  • Redundancy 列的和不应超通量上限(如 4096 或 65536)。

其他建议和规则

[1]

Oligo_ID_and_Seq 表单中,每行代表一种唯一的寡核苷酸序列;比如用户需要使用 4K 通量芯片合成 1800 种不同序列,每种序列在芯片的不同坐标处合成 2 个拷贝, 该表单中应填写 Oligo_No 为 1 至 1800 的行, 并将 Redandancy 设置为 2, 而非填写 Oligo_No 为 1 至 3600 的行。

[2]

Oligo_No 为“0”、Oligo_ID 为“Demo_Oligo”的行为示例行,请勿进行修改;

该行内容不参与合成,不会出现在合成产物中。

[3]

原则上,Oligo_Seq 应尽可能与 Oligo_ID 一一对应、保持无重复;
同一 Oligo_ID 只能对应一种 Oligo_Seq
不同 Oligo_ID 对应相同 Oligo_Seq 的情况是被允许的,但我们依然建议您进行核实。

[4]

应避免出现 Oligo_ID 为空但 Oligo_Seq 不为空的情况。

产物质量相关提示

[1]
如果您对产物的产量有一定要求,或是下游实验涉及扩增,我们强烈建议您设置 通用引物序列  
[2]
使用同一对引物进行扩增的一个寡核苷酸池或者一个子池(subpool)内,如果不同序列长度差异较大,可能会造成合成载量的差异, 以及较严重的扩增偏好性差异,使扩增产物的均一性受到较大影响。
[3]
如果您需要使用polyX 序列补齐序列长度, dT 是较为推荐的碱基类型。
[4]
过多的 dAdG 碱基含量,可能对合成质量造成影响。
[5]
过高、过低、不同序列间差异较大的 CG% 含量,可能使扩增产物的 均一性 受到较大影响。

Dr. Kang Kang

Partner & CBio

Dr. Kang received his Ph.D. in Bioinformatics and Systems Biology from the University of Hong Kong in 2018, then became a scientific co-worker of the Leibniz Association (Leibniz-HKI) and a visiting scientist at the Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability (DTU Biosustain) at the Technical University of Denmark. He was a scientist at BGI-Shenzhen and co-founded the synthetic biology research group. He was a senior bioinformatics engineer and brand advisor at WeGene. In 2021, Kang joined Biosysen Limited as a co-founder and served as Chief Informatics Scientist. He is also an advisor and author of the biotech media "Regenesis". He has been dedicated to the R&D and industrialization of OMICs technologies, high-throughput technologies, and synthetic biology for over 10 years. He joined LinkZill in March 2023, responsible for semiconductor life science tools and product planning.

康康   博士

合伙人兼首席生物信息官

博士毕业于香港大学生物信息和系统生物学专业,后任德国莱布尼茨协会科学合作者、丹麦科技大学诺和诺德生物可持续研究中心访问科学家。曾先后担任华大基因科学家,参与创立了华大基因合成生物学研究方向;微基因资深生物信息工程师、品牌顾问;倍生生物联合创始人兼首席信息科学家。他专注于合成生物学、组学和高通量技术10余年,同时也是生物技术领域颇具影响力的「行业KOL」。2023年3月加入领挚科技,负责半导体生命科学工具方向与产品规划。